Le CPIE Bugey Genevois détient plusieurs agréments.
L'agrément ministériel "jeunesse et éducation populaire": L’agrément revêt par ailleurs un caractère valorisant : c’est un label de qualité qui reconnaît la valeur éducative de l’association.
L'agrément CROSS (Comité Régional de l'Organisation Sanitaire et Sociale ): l'agrément est délivré par la Région Auvergne Rhône-Alpes pour le service de placement familial.
L'agrément de la Direction de la Cohésion Social de Haute-Savoie: pour l'accueil de volontaires en service civique